Группа учёных из Рокфеллеровского университета обнаружила в обычной почве не только сотни неизвестных бактериальных геномов, но и два ранее неописанных антибиотика. При этом они не культивировали бактерии — вместо этого специалисты выделили длинные участки ДНК прямо из почвы, восстановили геномы и на их основе спрогнозировали биоактивные соединения, которые затем синтезировали.
С одного образца исследователи получили 2,5 терабайта данных — такое глубокое секвенирование одного почвенного участка ещё не проводилось. Более 99 % обнаруженных геномов не имели совпадений в существующих базах.
Первый из найденных антибиотиков — эрутацидин — нарушает целостность бактериальной мембраны через взаимодействие с кардиолипином. Второй, тригинтамицин, влияет на работу клеточного мотора ClpX, участвующего в разворачивании белков.
Авторы исследования подчёркивают, что их подход можно использовать не только для почвы, но и для других микробных сред, включая океан или кишечник, что открывает большие возможности для открытия новых лекарственных веществ.
Источник: Hi-Tech Mail .
Анна Сальникова
